中心采用校、院二级管理模式，实行主任负责制，建立了学校及中心系列管理制度并有效实施。2020年9月，从日常管理、安全、考核及防疫角度对中心各项管理规章制度进行重新制修订，重点制修订《临床技能实训中心实训室管理基本规定》、《临床技能实训中心开放工作实施办法》、《考核中心管理制度》、《天津中医药大学医学类专业毕业考核工作流程》等相关规章制度文件15项，确保中心稳定运行。